MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015850	ACC	2	6	172196	172201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3502	NC_015850	CGG	2	6	172215	172220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3503	NC_015850	ATG	2	6	172251	172256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3504	NC_015850	GGAC	2	8	172284	172291	25 %	0 %	50 %	25 %	340780914
3505	NC_015850	GGC	2	6	172335	172340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3506	NC_015850	TGC	2	6	172371	172376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3507	NC_015850	TAT	2	6	172412	172417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780914
3508	NC_015850	TGA	2	6	172497	172502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3509	NC_015850	GGA	2	6	172540	172545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780914
3510	NC_015850	GCC	2	6	172556	172561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780914
3511	NC_015850	GGC	2	6	172633	172638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3512	NC_015850	GGT	2	6	172653	172658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780914
3513	NC_015850	CAT	2	6	172696	172701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3514	NC_015850	CAA	2	6	172705	172710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780914
3515	NC_015850	CTG	2	6	172883	172888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3516	NC_015850	TGGA	2	8	172895	172902	25 %	25 %	50 %	0 %	340780914
3517	NC_015850	GTG	2	6	172907	172912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780914
3518	NC_015850	CGG	2	6	172947	172952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3519	NC_015850	CCA	2	6	173001	173006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3520	NC_015850	CCA	2	6	173088	173093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3521	NC_015850	TCG	2	6	173097	173102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3522	NC_015850	GCT	2	6	173152	173157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3523	NC_015850	GCC	2	6	173216	173221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780914
3524	NC_015850	ATG	2	6	173270	173275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3525	NC_015850	GAC	2	6	173294	173299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3526	NC_015850	CAA	2	6	173320	173325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780914
3527	NC_015850	TCA	2	6	173406	173411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3528	NC_015850	ATG	2	6	173417	173422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3529	NC_015850	TCG	2	6	173451	173456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3530	NC_015850	GGC	2	6	173553	173558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3531	NC_015850	CGG	2	6	173607	173612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3532	NC_015850	CCTGCT	2	12	173665	173676	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	340780914
3533	NC_015850	TCA	2	6	173763	173768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3534	NC_015850	CAT	2	6	173830	173835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780914
3535	NC_015850	CAG	2	6	173969	173974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3536	NC_015850	CCA	2	6	173985	173990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780914
3537	NC_015850	CTG	2	6	174014	174019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3538	NC_015850	TGA	2	6	174033	174038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3539	NC_015850	C	6	6	174112	174117	0 %	0 %	0 %	100 %	340780914
3540	NC_015850	CAG	2	6	174128	174133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3541	NC_015850	CTG	2	6	174134	174139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780914
3542	NC_015850	GCC	2	6	174170	174175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780914
3543	NC_015850	GAA	2	6	174277	174282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780914
3544	NC_015850	CGG	2	6	174292	174297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914
3545	NC_015850	GA	3	6	174370	174375	50 %	0 %	50 %	0 %	340780914
3546	NC_015850	GGGAA	2	10	174390	174399	40 %	0 %	60 %	0 %	340780914
3547	NC_015850	AGCG	2	8	174410	174417	25 %	0 %	50 %	25 %	340780914
3548	NC_015850	GAT	2	6	174453	174458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780914
3549	NC_015850	AGG	2	6	174532	174537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015850	A	6	6	174544	174549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015850	TGT	2	6	174622	174627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_015850	GCC	2	6	174725	174730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780915
3553	NC_015850	GACC	2	8	174744	174751	25 %	0 %	25 %	50 %	340780915
3554	NC_015850	TCCC	2	8	174783	174790	0 %	25 %	0 %	75 %	340780915
3555	NC_015850	CCG	3	9	174823	174831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780915
3556	NC_015850	AGT	2	6	174865	174870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780915
3557	NC_015850	ATC	2	6	175006	175011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780915
3558	NC_015850	CGG	2	6	175050	175055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780915
3559	NC_015850	CAAT	2	8	175074	175081	50 %	25 %	0 %	25 %	340780915
3560	NC_015850	CTT	2	6	175144	175149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780915
3561	NC_015850	TGC	2	6	175194	175199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780915
3562	NC_015850	GAA	2	6	175360	175365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780915
3563	NC_015850	TCG	2	6	175433	175438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780915
3564	NC_015850	CAG	2	6	175468	175473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780915
3565	NC_015850	AGTTG	2	10	175479	175488	20 %	40 %	40 %	0 %	340780915
3566	NC_015850	AGA	2	6	175521	175526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780915
3567	NC_015850	GC	3	6	175541	175546	0 %	0 %	50 %	50 %	340780915
3568	NC_015850	C	6	6	175742	175747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3569	NC_015850	ACC	2	6	175770	175775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_015850	CAG	2	6	175784	175789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_015850	CTT	2	6	175790	175795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_015850	ATTG	2	8	175863	175870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015850	ATG	2	6	175888	175893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780916
3574	NC_015850	AGA	2	6	175901	175906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780916
3575	NC_015850	GAT	2	6	175942	175947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780916
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3577	NC_015850	GGCC	2	8	176019	176026	0 %	0 %	50 %	50 %	340780916
3578	NC_015850	TCCC	2	8	176054	176061	0 %	25 %	0 %	75 %	340780916
3579	NC_015850	TGA	2	6	176066	176071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780916
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3583	NC_015850	AG	3	6	176466	176471	50 %	0 %	50 %	0 %	340780916
3584	NC_015850	TAT	2	6	176583	176588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780916
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3587	NC_015850	GAA	2	6	176745	176750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780916
3588	NC_015850	TCGC	2	8	177014	177021	0 %	25 %	25 %	50 %	340780916
3589	NC_015850	GAAA	2	8	177098	177105	75 %	0 %	25 %	0 %	340780916
3590	NC_015850	GTG	2	6	177173	177178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780916
3591	NC_015850	TGA	2	6	177183	177188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780916
3592	NC_015850	CAA	2	6	177378	177383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015850	T	6	6	177389	177394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_015850	T	6	6	177568	177573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_015850	CCG	2	6	177643	177648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_015850	TGCG	2	8	177744	177751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_015850	GCCTTG	2	12	177762	177773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_015850	TGCG	2	8	177878	177885	0 %	25 %	50 %	25 %	340780917
3599	NC_015850	GCCTTG	2	12	177896	177907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780917
3600	NC_015850	ATG	2	6	177995	178000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780917
3601	NC_015850	GGC	2	6	178022	178027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780917
3602	NC_015850	TGG	2	6	178079	178084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780917
3603	NC_015850	TTTC	2	8	178179	178186	0 %	75 %	0 %	25 %	340780917
3604	NC_015850	CGT	2	6	178275	178280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780917
3605	NC_015850	ACC	2	6	178414	178419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780917
3606	NC_015850	CTG	2	6	178541	178546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780917
3607	NC_015850	GCA	2	6	178589	178594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780917
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3609	NC_015850	GCC	2	6	178839	178844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780917
3610	NC_015850	CTC	2	6	178876	178881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780917
3611	NC_015850	AGCA	2	8	178893	178900	50 %	0 %	25 %	25 %	340780917
3612	NC_015850	TCC	2	6	178946	178951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780917
3613	NC_015850	CCA	2	6	178971	178976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780917
3614	NC_015850	CGG	2	6	178981	178986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780917
3615	NC_015850	GA	3	6	179002	179007	50 %	0 %	50 %	0 %	340780917
3616	NC_015850	GAGG	2	8	179105	179112	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_015850	GCC	2	6	179121	179126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_015850	T	6	6	179142	179147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_015850	AAGA	2	8	179152	179159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_015850	TTA	2	6	179209	179214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_015850	TAC	2	6	179256	179261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780918
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3623	NC_015850	CCT	2	6	179475	179480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780918
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3743	NC_015850	TA	3	6	185575	185580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_015850	AATA	2	8	185585	185592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3745	NC_015850	AAT	2	6	185614	185619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3998	NC_015850	ACC	2	6	198757	198762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780938
3999	NC_015850	CTG	2	6	198767	198772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780938
4000	NC_015850	GCCA	2	8	198874	198881	25 %	0 %	25 %	50 %	340780938

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